工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！

与冥王哈迪斯惨烈战斗终于结束，世界再次回到光明之中。但对于圣斗士来说，却伤亡何其惨重。黄金圣斗士全部阵亡，星矢虽然在最后的决战中侥幸逃生，却落得五感尽失，形同废人。
然而，这来之不易的和平却无法持续太久，在经历了撒加叛乱、海神波塞冬、冥王哈迪斯等危机之后，另一支邪恶之手也向人类世界伸来。这便是太阳神阿波罗——女神雅典娜的哥哥。他此番带领神斗士前来，企图将人类消灭。对于雅典娜及其麾下的圣斗士来说，这是前所未有的大危机…… 

晴朗的一天，悟饭和比迪丽正在教室上课，这是接到一条求助信息。原来有个老头准备跳楼自杀，他们连忙化身赛亚超人前去营救。从这个奇怪的老头口中，他们得知距今一千五百年前，南银河科纳兹星球曾有一名超级英雄塔皮欧，后来不知何种原因被困在音乐盒中。为防止即将到来的大灾难，孙悟空父子在老头的请求下召唤了神龙，终于救出塔皮欧，却发现塔皮欧并不领情，而老头似乎又隐藏着某种阴谋。此后不久，一个邪恶的怪物出现在都市之中，它只有下半截身体，上半截则被封印在塔皮欧的体内。一切昭然若显，龙珠战士则面临巨大的危机……
　　本片为《龙珠Z》剧场版